云南農(nóng)業(yè)大學研究生教育始于1983年。2003年學校增列為博士授權(quán)單位。到2013年底有3個一級學科博士學位授權(quán)點、11個二級學科博士學位授權(quán)點。博士生導師56人;12個一級學科碩士學位授權(quán)點、56個二級學科碩士學位授權(quán)點,碩士研究生指導教師482人。學校具有農(nóng)業(yè)推廣碩士學位、獸醫(yī)碩士學位和工程碩士學位招生權(quán),還有高校教師在職攻讀碩士學位授予權(quán),在職人員以同等學力申請碩士學位審批權(quán)和外國留學生招生權(quán);2008年,經(jīng)教育部批準,我校獲得推薦本科畢業(yè)生免試攻讀碩士學位權(quán)。目前,培養(yǎng)研究生的學科涉及農(nóng)學、理學、工學、管理學和法學 5大學科門類。